NanoDrop检测如何合理的控制DNA标本的质量 260/230值的意义

这项研究的目的主要是在进行基因芯片检测前,合理的控制DNA标本的质量可以避免基因芯片不必要的浪费,可以提高并且标本质量控制的有效性。

NanoDrop检测:一种全波长紫外/可见光扫描分光光度计。它可以检测DNA、RNA、蛋白质和染料等的吸光度。它可以自动识别个光谱范围是220到750nm的波长。

在用NanoDrop检测标本浓度前应先对它校正。校正时,我们选用浓度310ng/pl,用TE液将它稀释成从3.1~310ng/pl之间的5个不同浓度,用NanoDrop1000分别检测这5个浓度的吸光度并绘制成线,根据线的拟合度判断仪器的精确性。

 NanoDrop检测如何合理的控制DNA标本的质量 260/230值的意义 第1张

1、将仪器的USB线连上电脑,打开ND.1000软件,选择核酸定量。

2、按照提示在仪器的加样表面上,加1IⅡL蒸馏水,放下上探头,按OK键。仪器自检,通过后可继续使用。

3、擦净后,加入lul的TE液,点Blank键,仪器以TE液为空白对照,进行调零。

4、将加样表面和上探头的液体都用滤纸吸去,加入1mLDNA样品于加样表面,放下上探头。在软件右边的SampleID中输入样本编号,点Measure,仪器开始定量检测。各波长的吸光度结果和样本浓度会自动测出。

5、将加样表面和上探头的BNA样品用滤纸吸去,加上第二个DNA样品,点260/230值对全基因组关联研究样本质检的重要意义Measure,仪器继续测量下一个样品。

在一些实验室里,质控主要是用NanoDrop和PicoGreen的方法。纯的核酸通常DNA和RNA的260/280值分别在1.8和2.0左右。这个比值主要是取决于PH以及作为空白和样本检测的缓冲液的离子浓度。酸性溶液会使比值降低0.2-0.3,而基本的溶液会使比值升高0.2-0.3。很明显地不同纯度的比值可能显示有蛋白质、酚类或其他杂质,吸光度可能会高于或在280nm附近。

260/230的比值也被认为可以衡量DNA纯度的标准,较纯的核酸260/230值通常是在1.8-2.2。如果比值明显低于这个范围,则提示所用的DNA提取方法有问题需要260/230值对全基因组关联研究样本质捡的重要意义改进。

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